Издаване на фактура от ФЛ за доходи от наем

Фирма с регистрация по ЗДДС сключва договор за наем с ФЛ. ФЛ няма регистрация по ЗДДС, за идентификационен номер има посочено ЕГН. ФЛ издава фактура за наем. Фактурата е на стойност, посочена в договора. Плащането е извършено по банка, като няма цитиран номер на фактура, а само - наем за месец... Сумата в платежното е по-малка от сумата на фактурата. Съответно има нормативно признати разходи и удържан от ЮЛ авансов данък. Фактурата е представена вместо сметка за изплатени суми за доказване на разходи за наем, свързани с програмата за подкрепа на микро, малки и средни предприятия. Има ли право ФЛ да издава фактура и дали биха я приели проверяващите за документ доказваш разход за наем?